tutorial: ExPASy base de datos de proteínas (I)

martes, 20 de octubre de 2009
De ésta forma doy comienzo a un pequeño tutorial soobre ExPASy y como utilizarlo, de manera de sacarle el mayor provecho a las bases de datos de proteínas para tu estudio, investigación...
Expert Protein Analysis System (ExPASy) es un servidor de proteomica fundada y mantenida por la SIB (Swiss Institute of Bioinforrmatics) desde 199 3. Su base de datos incluyen miles de proteínas caracterizadas y dedicadas al análisis de la secuencia de proteínas así como de su estructura 2D y 3D.´Es una herramienta para todos aquellos que nos interesa el área de la bioinformática e investigadores del área de la bioquímica, genética, biología celular y molpecular. ExPASy es una base de datos, actualizada, de prácticamente todas las proteías caracterizadas de todos los reinos.

expasy cuenta con secuencias de aminoácidos con sus polimorfismos, la estructura proteica 3D y 2D en pruebas de electroforesis , enlaces a artíulos de revistas biomédicas con información sobre la búsqueda, enlaces a bases de datos genéticas, biológicas.La búsqueda de la proteína que necesites debe ser especifica, ya que la base de datos es muy amplia...no soo arroja los resultados en base al nombre de la proteína que introduzcamos en la barra de búsquwda, sino que expresa cada una de las que tengan alguna relación con la misma. Por ejemplo si introducimos el criterio "insulin" (insulina) no sól o aparecerán todas las moléculas de insulina caracterizadas en el reino animal sino que también aparecerán los receptores de insulina, los IGF (factores de crecimiento insulnoide), sustrato del receptor de insulina (IRS-1) enre ogros.


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Extraido de MedChronicles

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